Реляционная модель базы для хранения эколого-биологических экспедиционных данных

от

А.М. Лях1, И.В. Агаркова-Лях2

 1 ФГБУН Федеральный исследовательский центр «Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского РАН», РФ, г. Севастополь, пр-т Нахимова, 2

E—mail: me@antonlyakh.ru

2 ФГБНУ Институт природно-технических систем, РФ, г. Севастополь, ул. Ленина, 28.

E-mail: iva_crimea@mail.ru

DOI: 10.33075/2220-5861-2021-3-98-106

УДК 574.1+004.65                                                                                                         

Реферат:

   Многие эколого-биологические данные, особенно архивные, а также аннотации к публикациям, содержат названия мест отбора проб без координат. То есть географические названия выступают основным источником сведений о локации места. Поэтому цель работы заключалась в описании реляционной модели базы для хранения эколого-биологических данных, в которой основной акцент сделан на географические названия.

   Система географических территорий имеет много общего c системой биологических таксонов. Такое подобие позволяет использовать для их хранения совпадающую структуру таблицы БД. Таблица содержит дерево названий, описанное структурой «материализованный путь». Дополнительное поле «status» описывает номенклатурный статус названия, а поле «rank» зарезервировано для типа географического объекта.

   Официально признанные и неофициальные территории образуют единую иерархическую систему, объединенную вертикальными связями. В дереве все названия распределены между двумя крупным ветвями: сушей и акваторией. Но так как приморские территории граничат с прибрежными акваториями, то для хранения таких горизонтальных связей соседства используется поле «neighbor». Оно содержит идентификатор прилегающего участка территории или акватории. Водоемы и водотоки, расположенные на суше, тоже являются частью гидросферы, но пространственно относятся к суше. Для обозначения таких водных объектов предусмотрено поле «aquatory». Отрицательное значение поля показывает, что это водный объект расположенный на суше.

   Общая структура экспедиционной базы данных включает таблицы: с названиями географических территорий, описанием экспедиций, мест отбора и характеристик проб. Таблица для хранения первичных данных в реляционной модели не отражена. Описанная структура БД позволяет привязывать собранные экспедиционные данные к названию местности, что помогает представлять географию собранных данных в естественном для исследователя виде.

Ключевые слова: географические данные, географические названия, территория, акватория, база данных, информационная система, иерархия географических названий.

Для цитирования: Лях А.М., Агаркова-Лях И.В. Реляционная модель базы для хранения эколого-биологических экспедиционных данных // Системы контроля окружающей среды. 2021. Вып. 3 (45). C. 98-106.

Полный текст в формате PDF

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

  1. Барахнин В.Б., Жижимов О.Л., Куперштох А.А., Скачков Д.М., Федотов А.М. Алгоритм извлечения из текстовых документов географических названий, отражающих содержание // Вестник НГУ. Серия: Информационные технологии. 2012. Т. 10, № 1. С.109–120.
  2. Rodosthenous C.T., Michael L. GeoMantis: Inferring the Geographic Focus of Text using Knowledge Bases // ICAART. 2018. P. 111–121.
  3. Лях А.М., Лелеков С.Г. Модульная структура таксономической базы данных // Электронные информационные системы. 2018. № 2 (17). С. 59–70.
  4. Лях А.М. Минимальная структура базы для хранения данных о биологическом разнообразии организмов // Труды СПИИРАН. 2020. Т. 19, № 4. С. 855–879.
  5. Mennis J. Multidimensional map algebra: design and implementation of a spatio-temporal GIS processing language // Trans. GIS. 2010. Vol. 14. P. 1–21.
  6. Gebert S., Leppelt T., Pebesma E. A topology-based spatio-temporal map algebra for big data analysis // Data. 2019. 4 (2), 86.
  7. Электронная коллекция паразитов рыб Мирового океана Института морских биологических исследований им. А.О. Ковалевского / Е.В. Дмитриева, А.М. Лях, Ю.М. Корнийчук [и др.] // Морской биологический журнал. 2016. Т. 1, № 3. С. 27–31.
  8. Агаркова-Лях И.В., Лях А.М. Условия развития и активность экзогенных геологических процессов на берегах Юго-Западного Крыма от м. Айя до м. Сарыч // Известия Саратовского университета. Серия «Науки о Земле». 2020. Т. 20, № 2. С. 76-85.
  9. Шуйский Ю.Д., Выхованец Г.В., Орган Л.В. Вдольбереговые литодинамические системы в береговой зоне северо-западной части Черного моря // Причерноморский экологический бюллетень. 2010. №. 1 (35). С. 74–83.
  10. Wieczorek J., Bloom D., Guralnick R., Blum S., Doring M., Giovanni R., Robertson T., Vieglais D. Darwing Core: an evolving community-developed biodiversity data standard // PLoS ONE. 2012. Vol. 7. P. 1–8.
  11. Скачков Д.М., Жижимов О.Л. Об интеграции географических метаданных посредством ретроспективного тезауруса // Информатика и ее применение. 2012. Т. 6, вып. 3. С. 43–51.
  12. Жижимов О.Л. Технология извлечения географических названий из текстовых документов на основе инструментария PostgreSQL // Вестник Восточно-Казахстанского государственного технического университета им. Д. Серикбаева. 2018. № 1–3. С. 195–203.
  13. Королева И.А. Микротопонимы и неофициальные региональные топонимы (к постановке вопроса) // Известия СмолГУ. 2016. № 4 (36). С. 94–103.
  14. Королева И.А. Топонимы как свернутый лингво-культурный код // Вестник БФУ им. И. Канта. 2015. Вып. 8. С. 31–38.
  15. Patterson D.J., Cooper J., Kirk P.M., Pyle R.L., Remsen D.P. Names are key to the big new biology // Trends in Ecology and Evolution. 2010. Vol. 25 (12). P. 686–691.
  16. Peruzzi L. Using scientific names guarantees universality of communication in science… but are plant biologists aware of it? // Plant Biosystems – An International Journal Dealing with all Aspects of Plant. 2020. Vol. 154. № 6. P. 1000–1002.
  17. Эволюция стандарта  ZOOCOD  – концепция отражения экологических иерархических классификаций в плоских таблицах реляционных баз данных / Л.А. Лобанов,  И.С. Смирнов,   М.Б. Дианов [и др.] // Электронные библиотеки: перспективные методы и технологии, электронные коллекции. Сборник трудов Всероссийской научной конференции RCDL’2008. Дубна, 2008. С. 326–332.
  18. Ревков Н.К. Некоторые замечания по составу и многолетней динамике фауны моллюсков рыхлых грунтов Юго-Восточного Крыма (Черное море) // 95 лет Карадагской научной станции: Сб. науч. трудов. 2009. С. 251–261.
  19. Жиянов А. Как упростить пользователю жизнь. https://antonz.ru/simplify-users-life/ (дата обращения: 18.08.2021).
  20. Бирман И. Как сделать интерфейс дружелюбным? Бюро Горбунова. https://bureau.ru/bb/soviet/20150714/ (дата обращения: 07.08.2021).

Loading