Изоляция альговирусов Tetraselmis viridis и Phaeodactylum tricornutum из донных отложений у побережья Крыма и Юго-запада России

от

О.А. Степанова

Институт природно-технических систем, РФ,  г. Севастополь, ул. Ленина, 28

E-mail: solar-ua@ya.ru

DOI: 10.33075/2220-5861-2019-4-123-127

УДК 578.4(262.5)

Реферат:

     По данным литературы в донных отложениях как морских, так и пресных водоемов исследователи определяли численность вирусов при помощи эпифлуоресцентной микроскопии, устанавливали наличие и разнообразие вирусов при помощи полимеразной цепной реакции, а также проводили поиск и изоляцию альговирусов с использованием индикаторных культур микроводорослей. Однако для изоляции альговирусов как Черного, так и Азовского, моря донные отложения ранее никогда использованы не были.Цель выполненной работы – поиск и выделение альговирусов из донных отложений (грунтов), отобранных у побережья Крыма и Юго-запада РФ.

     В экспедиции 106 рейса НИС «Профессор Водяницкий», проходившей в период с 18.04.19 г. по 13.05.19 г., с помощью пробоотборника «Box corer» были отобраны донные отложения (грунты). Отбор проб проводили с разной глубины (от 10 м до 2200 м) на станциях, расположенных по всему периметру полуострова Крым, в т.ч. и в Азовском море, а также у прилегающего черноморского побережья материка РФ, у г. Анапа, Туапсе, Сочи, Геленджик. Полученные пробы донных отложений изучали при помощи запатентованных авторских способов (65864A UA, N2003065499, 2004; 97293 С2 UA, № а 2010 03881, 2012).

     Впервые выполненные исследования по поиску и изоляции альговирусов микроводорослей Tetraselmis viridis (TvV) и Phaeodactylum tricornutum (PtV) из 26 проб донных отложений, отобранных у побережья полуострова Крым и Юго-запада России, позволили изолировать 20 вариантов альговирусов, среди которых 15 штаммов PtV и 5 штаммов TvV. Большее разнообразие альговирусов при изоляции как PtV, так и TvV наблюдалось в донных отложениях Азовского моря и у черноморского побережья Юго-запада РФ. В основном альговирусы были выделены из донных отложений, отбор которых проводили с небольшой глубины – до 180 м.

Ключевые слова: альговирусы, донные отложения, Черное море, Азовское море, черноморское побережье у полуострова Крым и Юго-запада РФ.

Для цитирования пройдите по ссылке DOI и используйте опцию Actions-Cite или скопируйте:
[IEEE] “ИЗОЛЯЦИЯ АЛЬГОВИРУСОВ TETRASELMIS VIRIDIS И PHAEODACTYLUM TRICORNUTUM ИЗ ДОННЫХ ОТЛОЖЕНИЙ У ПОБЕРЕЖЬЯ КРЫМА И ЮГО-ЗАПАДА РОССИИ”, Системы контроля окружающей среды, вып. 4, с. 123–127, декабрь, 2019.

Полный текст в формате PDF

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

  1. Лихошвай Е.В. В каждой капле воды – вирусы // Наука из первых рук. 2016. Т. 70. № 4. С. 88–94.
  2. Middelboe M, Brussaard C. Marine Viruses: Key Players in Marine Ecosystems // Viruses. 2017. Vol. 9. N 10. P. 302–308.
  3. Proposal for SCOR WG to Investigate the Role of Viruses in Marine Ecosystems // Proceedings of the Scientific Committee on Oceanic Research (Venice, Italy, Sept. 2004). Baltimore (USA), 2005. Vol. 40. P. 66–70. (Annex 4).
  4. Suttle C.A. Marine viruses — major players in the global ecosystem // Nature Reviews Microbiology. 2007. N 5. P. 801–812.
  5. 5.Viruses of Eukaryotic Algae: Diversity, Methods for Detection, and Future Directions / R. Coy, E.R. Gann, H.L. Pound [et al.] // Viruses. 2018. Vol. 9. N 10. P. 487–514.
  6. Wommack K.E., Colwell R.R. Virioplankton: Viruses in aquatic ecosystems // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2000. Vol. 64. N 1. P. 69–114.
  7. Manual of aquatic viral ecology. Limnology and Oceanography e-Books. 2010, by the American Society of Limnolgy and Oceanography. Chapter 1–19. 201 p.
  8. Степанова О.А. Экология аллохтонных и автохтонных вирусов Черного моря. Севастополь: Мир. 2004. 308 с.
  9. Степанова О.А. Черноморские альговирусы //  Биология   моря.  2016. Т. 42. № 2. С. 99–103.
  10. Stepanova O.A., Solovyova Y.A., Solovyov A.V. Results of Algae Viruses Search in Human Clinical Material // Ukrainica Bioorganica Acta. 2011. N 2. P. 53–56.
  11. Chlorovirus ATCV-1 is part of the human oropharyngeal virome and is associated  with changes in cognitive functions in humans and mice / R.H. Yolken, J.B. Lorraine, D. Dunigan [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2014. Vol. 111. N 45. P. 16106–16111.
  12. Степанова О.А. Морские бактерии и вирусы в воде и донных осадках бухт Севастополя // Экология. 2001. № 1. С. 61–63.
  13. Danovaro R., Serresi M. Viral density and virus-to-bacterium ratio in deep-sea sediments of the Eastern Mediterranean // Appl. Environ. Microbiol. 2000. Vol. 66. N 5. P. 1857–1861.
  14. Determination of Virus Abundance in Marine Sediments / R. Danovaro,  A. Dell’Anno, A. Trucco [et al.] // Appl. Environ. Microbiol.  2001.  Vol. 67. N 3. P. 1384–1387.
  15. Algal viruses and cyanophages have distinct distributions in Lake Erie sediments / A.M. Long, M. Staniewski, S. Wilhelm [et al.] // Aquatic Microbial Ecology. 2018. Vol. 82. N 2. P. 161–175.
  16. Previously Unknown Virus Infect Marine Diatom / K. Nagasaki, Y. Tomaru, Y. Takao [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71. N 7. P. 3528–3535.

Loading